O Departamento Comercial e Marketing surge no sentido da promoção do UBIPharma, assim como dos seus produtos através da sua divulgação e venda, com o objetivo de financiar atividades científicas, culturais e académicas para os alunos do MICF. O Departamento Comercial e Marketing do UBIPharma encontra-se integrado na Coordenação Nacional Comercial (CnaC) da APEF.